（1）分子量定量

　　對于一般常用的DNA膠片,利用分子量定量功能,通過(guò)對膠上DNA Marker條帶的已知分子量注釋,自動(dòng)生成擬合曲線(xiàn),并以它衡量得到未知條帶的分子量。通過(guò)這種方法所得到的結果較肉眼觀(guān)察估計要準確很多。

　　（2）密度定量

　　一般常用的測定DNA(脫氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)濃度的方法是紫外吸收法,但它只能測定樣品中的總核苷酸濃度,而不能區分各個(gè)長(cháng)度片段的濃度。利用熒光化學(xué)發(fā)光凝膠成像系統和軟件,先將DNA膠片上某一已知其DNA含量的標準條帶進(jìn)行密度標定以后,可以方便的單擊其他未知條帶，根據與已知條帶的密度做比較，可以得到未知DNA的含量。此方法也適用于對PA GE蛋白膠條帶的濃度測定。

　　（3）密度掃描

　　在分子生物學(xué)和生物工程研究中,zui常用到的是對蛋白表達產(chǎn)物占整個(gè)菌體蛋白的百分含量的計算。傳統的方法是利用的密度掃描,但利用生物分析軟件結合現在實(shí)驗室常規配備的掃描儀或者直接用白光照射的熒光化學(xué)發(fā)光凝膠成像系統就能完成此項工作。

　　（4）PCR定量

　　PCR定量主要是指，如果PCR實(shí)驗擴增出來(lái)的條帶不是一條，那么可以利用軟件計算出各個(gè)條帶占總體條帶的相對百分數。就此功能而言，與密度掃描類(lèi)似，但實(shí)際在原理上并不相同。PCR定量是對選定的幾條帶進(jìn)行相對密度定量并計算其占總和的百分數，密度掃描時(shí)并對選擇區域生成縱向掃描曲線(xiàn)圖并積分。